因應南京玄奘寺被揭發曾供奉5名侵華日軍戰犯長生牌位的事件，國家宗教事務局發出通知，緊急部署各地指導宗教界深刻汲取教訓，對宗教活動場所開展全面自查整改，發現問題立即糾正，依法依規嚴肅處理。國家宗教事務局要求各地加大對宗教活動場所、宗教院校、宗教團體的督導巡查力度，指導宗教團體健全規章制度，支持宗教界全面從嚴治教，切實提高自我教育、自我管理、自我約束的水平。

同時，國家宗教事務局要求加強對宗教界的思想引領，指導宗教界持續深入開展愛國主義、集體主義、社會主義教育，深化黨史、新中國史、改革開放史、社會主義發展史學習，引導宗教界人士和信教群眾踐行社會主義核心價值觀，切實增強宗教界人士的國家意識、公民意識、法治意識，確保在大是大非和原則問題上始終保持頭腦清醒，堅決杜絕發生此類問題，切實維護宗教領域的和諧穩定。