台灣的防務部門否認報道指，美國要求台灣相關部門的預防醫學研究所，秘密建立研發病毒能力，開發生物戰劑。有關部門表示，預防醫學研究所的任務以執行傳染病病原偵檢、防護及治療為主，同時研發偵檢生物戰劑的試劑，以加強生物戰劑防衛偵檢能力，強調相關報道內容並非事實。
部門指，台灣曾簽署反生物戰劑公約，雖然後來因國際政治因素遭除名，但台灣仍依照公約要求，絕不發展、製造、儲存、取得或保有用於軍事用途的微生物製劑、其他生物製劑或毒素。