日本氣象廳首次發出「巨大地震注意」，總務省消防廳其後將29個都府縣的707個市町村，指定為南海海槽大地震防災對策推進地區，要求居民預先做好疏散準備。愛知、和歌山、高知及鹿兒島4縣19個市町村設立90多處避難所。東海道新幹線減速行駛。部分地方政府呼籲民眾避免不必要及非緊急的出行。
九州宮崎縣日向灘星期四發生7.1級地震，造成16人受傷。首相岸田文雄說，「巨大地震注意」令人憂慮，決定取消出訪中亞，以便政府可以迅速回應。
日本政府預防災難小組在2013年的報告指出，如果日本南部近岸發生9.1級地震，最壞情況可能引發10米高的海嘯，造成超過30萬人死亡。