港鐵北環綫古洞站今年第三季動工，2027年竣工，作為現有東鐵綫落馬洲支綫的新車站。政府前年到立法會交代時，仍然沿用2015年估算的項目造價35億元，不過當局在立法會鐵路事宜小組委員會上指，最新造價增至59億元，連同設計和前期工程約39億，總開支是98億。實政圓桌田北辰指，工程開支在短短2年內大增，形容是離譜。

路政署長陳派明指，造價上升主要因為通脹、在設計過程中採納了更詳細的風險評估及經核實的成本預算，以及更新的票務和非票務收入預測；又指古洞站項目的經濟內部回報率為6.5%，經濟效益大於支出。

當局指，有對港鐵的項目預算，進行嚴謹的審核把關，亦有委託獨立顧問公司進行審核，港鐵公司只會收取應得的財務資助。

港鐵表示，在營運中的東鐵綫上施工，同時維持鐵路服務是一大挑戰，施工範圍位於早前落馬洲支綫建造時預留土地，擺放機械和出入空間都受限，加上工地與現有東鐵綫緊急車輛通道和逃生出口重疊，須先將通道改道；港鐵會利用附近羅湖貨運站位置，在夜間利用鐵路運送建築物料，提升工程效率。

議員張欣宇關注，當局預計到2026至27年，古洞將有13萬人口，但港鐵未有因應古洞站啟用，增加東鐵綫班次，現時東鐵綫較過海段通車前，每小時仍少一班車，預計古洞站在繁忙時間1小時只得7班車，每班車要等8分鐘，相信列車到北區已經相當擠迫，批評港鐵沒有預先規劃，對北區居民並不公平。