區議會選舉投票原定晚上10時半截止，在晚上7時42分，全港投票站的電子選民登記冊系統故障，票站一度關閉半小時，投票站到8時12分轉用選民登記冊印刷本發出選票，選民要輪候更長時間投票；選管會主席陸啟康晚上宣布，投票時間將相應順延一個半小時，至午夜12時。又指現階段沒有證據顯示電腦系統有受網絡攻擊，並就今次故障致歉。

陸啟康指，選管會並沒有因為希望推高投票率而延長投票時間，一個半小時是考慮到公平及安全性，選民有時間可以投票。他又認為，有心要投票的選民不會接近完結才到場，如果是遲去投票的選民，明顯是受到系統故障影響，而推遲投票的時間。

資訊科技總監黃志光指，電子選民登記冊系統後台數據庫出現異常，看不到資料有特別高瀏覽量或受攻擊，整體網絡正常，沒有不正常流量，原因仍在調查中。他說，本來有後備方案，包括用15分鐘調查並修復，其後若補救失敗就會轉為人手方法投票。他又表示，前線人員會有投票紀錄，不必擔心會有人重覆投票。

投票站晚上改用人手紙本發票

選舉管理委員會晚上8時半宣布，由於電子選民登記冊系統故障，區議會選舉所有投票站已於8時12分起轉用選民登記冊印刷本發出選票。呼籲受影響的選民耐心等候，投票時間將相應順延，詳情留意選管會的公布。選管會主席陸啟康晚上將會見傳媒。

根據《區議會選舉活動指引》，如電子選民登記冊系統出現問題而不能如常運作，票站會啟動後備操作安排，利用正式選民冊印刷本發出選票，直至投票結束。票站工作人員須同時啟動電子選民登記冊系統的後備模式，於發出選票前查核場地內的儲存裝置，以確定有關選民從未於電子選民登記冊系統正常運作時到票站領取選票。儲存裝置以加密的模式儲存已領取選票的選民的身分證號碼，但不會儲存選民的姓名等其他個人資料。

在東涌票站，在故障超過一小時後，在近晚上9時重開，改用人手登記選民資料，約30名排隊等候的選民連續入內投票。有選民形形容出現故障是「失敗」，但為履行公民責任都等到票站重開。但有選民因要返夜班，未能等到票站重開，指唯有不投票，令他支持的候選人失去一票。

灣仔有票站標示等候時間30至60分鐘 有市民感失望

在灣仔區軒尼詩道官立小學票站，有長者晚上約7時45分來到，但職員指系統暫停，他相隔10分鐘再到票站，仍未能投票，感到失望。票站職員其後安排選民入內投票，有市民指，票站內標示等候時間為30至60分鐘，至少30人正排隊等候，她對系統故障感到驚訝，指若與長者同行未必會等。

在佐敦官立小學票站，有選民指，特意趕回來投票，對未能投票感到失望，若果票站遲遲未能重開，就會放棄投票。