星期一實施「三隧分時段收費」首個工作天早上，西隧一度收錯隧道費，歷時超過1小時，運輸署晚上表示，隧道費服務商已完成調查並提交報告，顯示是職員疏忽導致錯誤，警方調查後發現事件不涉及刑事成分。

當日隧道費服務商發現收費表由早上10時02分起出錯，到11時04分更正至正確的分時段收費表。調查顯示，負責系統的職員為分時段收費更新收費表時，過程中沒有即時清除一項舊有指令。星期一早上10時02分，另一名職員當進行日常運作批核時，錯誤一併批核舊有指令，以致分時段收費表被「633」舊收費表取代，因而錯收隧道費。

運輸署表示，星期三已召見隧道費服務商管理層，表達強烈不滿事件。署方亦會安排獨立審計，檢視服務商的系統操作流程，以及已經在系統操作關鍵流程中加入須取得運輸署許可的雙重認證，以確保不再發生同類事件。署方正詳細檢視調查報告內容，並會要求服務商作進一步改善。

隧道費服務商將推6項措施改善系統操作流程

易通行隧道費服務商表示，今日向運輸署提交調查報告，顯示事件屬個別人員操作失誤，已處分相關人員，包括發出書面警告信及終止主管人員的職務。

服務商表示會汲取教訓，進行6項改善措施，避免再發生同類事件，包括即時在系統操作關鍵流程中加入須取得運輸署許可的雙重認證；成立內部委員會，全面檢討「易通行」的業務規則及運作程序。定期進行內部審查，以確定有關人員遵守所有準則和程序； 進一步強化角色與職責的界定程序，並會對後台系統進行定期合規審查帳戶權限；成立緊急應變小組，監督未來任何臨時系統變更；加強各級員工的系統培訓；最後是聘請外部具備業務流程和系統審計專業知識的第三方顧問，以鞏固和審查業務規則及為操作程序進行全面檢討。

政務司司長陳國基星期二以署理行政長官身分，主持行政會議前見記者，曾指初步懷疑事件涉及有人干擾系統，由警方介入調查。若發現有人蓄意破壞，當局一定會嚴懲。事故中約4700架次車輛被多收錢，服務商已向3400個用戶退款，其餘1300個用戶尚未繳費用，退款工作已完成。