審計報告發現，工程開支預算超過460億的屯門至赤鱲角連接路，因進度受阻，延期完工開支達10億元，建議改善工程的管理。連接路共涉及8份工程合約，7份已經完成，1份仍在進行，而其中2份合約由於填海工程進度受阻，令後續工程無法如期開展，產生延期費用和工程受阻費用，總額達10億元，兩份合約亦較原訂完工時間延長779天和475天。

報告又發現，其中一份合約，承建商須建造1條行車通道，供日後隧道區域營運車輛使用，但行車通道的混凝土覆蓋、排水設施和緊急車輛通道標誌並無包括在合約範圍，最終要額外支付550萬要求承建商進行有關工程，為釐清工程細節，顧問需在合約下發出10個指示，額外費用共9260萬元。

報告又引述路政署指，其中2份合約的建築地盤發生過2宗致命意外，另外有7份合約的建築工地，發生173宗工業意外，涉事承建商多次遲交意外報告，最耐遲交98天，建議要提升建築工地安全。