立法會帳委會就審計報告發現，屯門至赤鱲角連接兩項主要工程延期及超支，召開公開聆訊。運輸及物流局長陳美寶表示，會汲取經驗，與發展局做好工程成本管控，又指在應急費用不足下，才會動用工程價格調整撥備。

會計界議員黃俊碩批評，顧問在工程前就建造緊急車輛通道等評估有欠準繩，導致出現更改令和額外開支。地產及建造界龍漢標指，當局在選用物料上把關不足，路政署在合約展開後才提出意見。

根據路政署資料，工程合約開始至去年8月期間，兩個建築工地各發生過1宗致命意外，另外有173宗非致命意外，而兩個承建商都有多次遲交意外報告。工聯會陸頌雄關注承建商表現會否影響日後投標。

路政署長邱國鼎指，承建商因需時調查等原因，遲報工業意外，政府招標時會考慮承建商3年內的表現，包括安全表現，當局會繼續引入4S安全智慧工地系統，利用科技提升地盤安全。